1.宮內感染的預防和遺傳學預測
有些原發性免疫缺陷病，可通過預測胎兒的性別或測定羊水中各種酶含量來預測胎兒出生后是否有某些原發性免疫缺陷病，以指導人類的優生。同時積極預防宮內感染，對降低本病的發生有較大的作用。
2.一般治療
感染是導致免疫缺陷病惡化的主要因素，應采取各種有效措施預防感染。一旦發生感染應積極控制。對于較嚴重的免疫缺陷病應避免使用免疫抑制劑或細胞毒性藥物。并避免預防接種。
3.補充療法
對于如先天性無丙種球蛋白或低丙種球蛋白者，可應用丙種球蛋白治療，常用劑量為每周25mg/kg，首次量加倍，如注射劑量較大，可分4～6處肌注。此外，新鮮血或干凍血漿可供給各種免疫球蛋白、補體、調理素和非特異性免疫活性成分。劑量為20ml/(kg?d)，輸注速度不可過快。
4.免疫重建
對于嚴重聯合免疫缺陷病、Wiskott-Aldrich綜合征、共濟失調毛細血管擴張癥等，均可進行骨髓移植重建免疫。對于Di-George綜合征、Nezelof綜合征等，可用胎兒胸腺移植重建免疫。
5.免疫功能調節劑
如胸腺素，5～10mg/d，3個月為一療程。轉移因子每周一次，每次2ml(每毫升含有1×109白細胞提取的轉移因子)。或采用左旋咪唑，2.5mg/(kg?d)，每周服2～3d，3個月為一療程。
6.中藥及針灸
可提高免疫功能，有一定臨床療效。