可并發肺水腫，胸腔積液；神經系統損害可發生中毒性腦病和腦水腫；心血管功能紊亂，出現休克，易并發心肌炎，心包炎；常可并發Reye綜合征；并可致腎臟病變，表現為血尿、蛋白尿；流感肺炎并發細菌感染者較多，常見致病菌為金黃色葡萄球菌，肺炎雙球菌，嗜血流感桿菌及溶血性鏈球菌等，其病變可為支氣管肺炎，大葉性肺炎或肺膿腫，多表現為單純性流感病毒肺炎病情好轉，熱退后又發熱，全身中毒癥狀加重，體溫升高，咳嗽加劇，呼吸困難，明顯發紺，胸部聽診有廣泛濕啰音，叩診濁音，血象白細胞與中性粒細胞顯著增高，偶見并發腦炎，彌散性血管內凝血（DIC）等疾病。