腎結核是全身性疾病，治療方面必須重視以下4條原則：
（1）全身治療與局部治療相結合 即在治療腎結核的同時，還要注意引起腎結核原發病灶的情況。
（2）抗結核治療與支持療法相結合 注意加強營養，提高患者免疫力與組織修復能力。
（3）內科治療與外科治療相結合 對于嚴重復雜的腎結核患者，尤其是發生閉合性腎膿腫、內科治療不能解除的尿路梗阻、或發生嚴重膀胱攣縮者，要內科治療與外科治療相結合。
（4）男性患者治療療程要適當延長 因為男性患者易并發生殖系統結核，所以男性患者藥物治療的療程要比女性適當延長。
