潛伏期10～60日，平均40日。一般起病急，黃疸多見。半數有發熱，伴有乏力、惡心、嘔吐、肝區痛。約1/3有關節痛。常見膽汁淤積狀，如皮膚瘙癢、大便色變淺較甲型肝炎明顯。多數肝大，脾大較少見。大多數病人黃疸于2周左右消退，病程6～8周，一般不發展為慢性。孕婦感染HEV病情重，易發生肝功能衰竭，尤其妊娠晚期病死率高，可見流產與死胎，其原因可能與血清免疫球蛋白水平低下有關。HBsAg陽性者重疊感染HEV，病情加重，易發展為急性重型肝炎。
