粬霉菌絲有隔膜，為多細胞霉菌。在幼小而活力旺盛時，菌絲體產生大量的分生孢子梗。分生孢子梗頂端膨大成為頂囊，一般呈球形。頂囊表面長滿一層或兩層輻射狀小梗（初生小梗與次生小梗）。最上層小梗瓶狀，頂端著生成串的球形分生孢子。以上幾部分結構合稱為"孢子穗"。孢子呈綠、黃、橙、褐、黑等顏色。這些都是菌種鑒定的依據。分生孢子梗生于足細胞上，并通過足細胞與營養菌絲相連。粬霉孢子穗的形態，包括分生孢子梗的長度、頂囊的形狀、小梗著生是單輪還是雙輪，分生孢子的形狀、大小、表面結構及顏色等，都是菌種鑒定的依據。
粬霉屬中的大多數僅發現了無性階段，極少數可形成子囊孢子，故在真菌學中仍歸于半知菌類。