有些治療癲癇的藥物還可能影響女性激素的分泌代謝，引起月經周期紊亂，甚或閉經，卵巢萎縮，導致不孕等嚴重后果。因此出現閉經應聯系您的主治醫師。
多囊性卵巢在普通人群中較為常見。多囊性卵巢綜合癥（多毛癥、痤瘡、肥胖、生殖能力低下、雄激素過多和月經紊亂）并不常見。有資料顯示，在女性癲癇病人中，多囊性卵巢疾病的發病率增加，而且服用丙戊酸后發病率更高。當然，這還是個極有爭議性的問題。也有證據表明，丙戊酸還可以增加無排卵性月經周期的危險。因此，作者在實踐中，對育齡期的婦女不使用丙戊酸，避免引起出生缺陷（脊柱裂）、多囊性卵巢綜合性、無排卵性月經周期和體重增加的諸多問題。