潰瘍性直腸炎的最初表現可有許多形式。血性腹瀉是最常見的早期癥狀。其他癥狀依次有腹痛、便血、體重減輕、里急后重、嘔吐等。偶爾主要表現為關節炎，虹膜睫狀體炎，肝功能障礙和皮膚病變。發熱則相對是一個不常見的征象，在大多數患者中本病表現為慢性、低惡性，在少數患者（約占15%）中呈急性、重癥暴發型。這些患者表現為頻繁血便，可多達30次/天，伴高熱、腹痛。
體征與病期和臨床表現直接相關，患者往往有體重減輕和面色蒼白，在疾病活動期腹部檢查時下腹部常有觸痛。可能有急腹癥征象伴發熱和腸鳴音減少，在急性發作或暴發型病例尤為明顯。由于頻繁腹瀉，還可發生肛周皮膚擦傷、剝脫、肛裂或肛瘺。直腸指檢感疼痛。直腸外表現：皮膚、黏膜、舌、關節和眼部的檢查極為重要。