1.病因鑒別
主要依據可引起眼球運動神經或神經核受損、或眼外肌麻痹的不同顱內或顱外疾病的診斷標準進行鑒別。
2.定位鑒別
眼球運動神經或神經核損傷的定位診斷鑒別則依據眼球運動障礙的不同特點及合并癥狀加以鑒別。