發病機制仍未完全清楚。MeCulloch總結有關克隆性增生資料后認為真性紅細胞增多癥的異常克隆具有以下3個特點：
①從單一細胞起源，持續增生；
②異常克隆具有優勢抑制正常克隆，晚期正常克隆消失；
③異常克隆具有細胞遺傳的不穩定性，臨床上偶爾見到真紅轉化為急性白血病的病例。類似現象可見于慢性粒細胞白血病、原發性血小板增多癥和原發性骨髓纖維化伴髓樣化生，McCulloch稱之為“克隆性血液病”。
