1.多呈亞急性或慢性起病，少數急性起病。多為機會性感染，患者大多合并全身性基礎疾病。20～40歲青壯年最常見。
2.臨床分為四型：腦膜炎型、腦膜腦炎型、肉芽腫型、囊腫型。首發癥狀常為間歇性頭痛、惡心及嘔吐，伴低熱、周身不適、精神不振等非特異性癥狀。隨病情發展，頭痛漸加重轉為持續性，精神異常，躁動不安，嚴重者出現不同程度意識障礙。
3.約半數以上伴腦神經受損，以視神經最常見，其次為第Ⅷ、Ⅲ、Ⅶ、VI腦神經。部分出現偏癱、抽搐、失語等局灶性腦組織損害癥狀。
4.腦膜刺激征為早期最常見的陽性體征，晚期可出現眼底水腫、錐體束征等。