RA的發病機制涉及B細胞、T細胞和樹突細胞之間復雜的相互作用。在多種環境因素和遺傳因素的作用下，機體對帶有瓜氨酸殘基的蛋白質的耐受性喪失，導致產生了自身抗體，例如抗環瓜氨酸蛋白/肽抗體（ACPA）和RF[5]。
還有可能是，這種特異性的抗原刺激誘導了可產生RF的B細胞，這些B細胞在經過同型轉換后，反過來進一步維持炎癥級聯反應。
RF參與免疫復合物形成，可能進一步導致了補體結合和炎癥細胞募集，如巨噬細胞、中性粒細胞和淋巴細胞。結果導致組織損傷，并為產生更多自身抗體提供正反饋回路。
這種機制可能解釋自身免疫和自我維持的炎癥反應，最終導致關節炎。