按單糖殘基、殘基間連鍵的類型以及硫酸基的數目和位置,糖胺聚糖可分為5個主要類別:
(1)透明質酸(HA)
(2)硫酸軟骨素(CS)
(3)硫酸皮膚素(DS)
(4)硫酸角質素(KS)
(5)硫酸乙酰肝素和肝素(HP)