日本營養健康食品協會規定納豆激酶的每日正常維持量應該不低于2000FU。
因此，醫學營養專家建議納豆激酶服用人群的基本用量如下：
1、每日攝取量2000FU，是正常或亞健康人群預防心腦血管疾病用量，多數人在服用7天左右身體出現反應，自覺精力充沛，眼睛干澀癥狀等開始好轉；敏感人群當天即有反應。
2、每日攝取量2000FU-4000FU，是心腦血管疾病患者建議用量，15天左右大多身體出現積極反應，比如手腳冰涼、胸悶心慌、肢體麻木、頭暈眼花、失眠等癥狀逐漸緩解，2-3個月左右血壓、血脂指標逐漸向正常值靠攏，待指標正常時可減量至健康維持量。
3、每日攝取量4000FU-6000FU，是心腦血管疾病重病患者建議用量，1月左右自覺癥狀開始減緩，維持3個月減緩明顯，待指標好轉后，可逐漸減量。