細胞工程根據研究材料的不同，可分為植物細胞工程和動物細胞工程，均主要由兩部分構成。
其一是上游工程，包含細胞培養、細胞遺傳操作和細胞保藏三個步驟。
第二則是下游工程，是將已轉化的細胞應用到生產實踐中去，以生產生物產品的過程。
其中細胞培養是細胞工程的技術基礎。
顧名思義，植物細胞工程，是在細胞水平上針對植物細胞的細胞工程，它是細胞工程的一個重要組成部分。
