（1）熱原質：大多數為革蘭陰性菌合成的菌體脂多糖。
（2）毒素：
◇內毒素：G-菌的脂多糖。
◇外毒素：G+菌產生的蛋白質，毒性強且有高度的選擇性。
（3）侵襲性酶：有些細菌還能產生具有侵襲性的酶，如卵磷脂酶、透明質酸酶等。
注：毒素和侵襲性酶在細菌致病性中甚為重要。
（4）色素：
◇水溶性色素
◇脂溶性色素
注：有鑒別作用。
（5）抗生素：是由某些微生物代謝過程中產生的、能抑制或殺死某些微生物和癌細胞的微量生物活性物質。
（6）細菌素：某些細菌菌株產生的一類具有抗菌作用的蛋白質，細菌素作用范圍狹窄，僅對與產生該種細菌素的細菌有近緣關系的細菌才能起作用，如大腸菌素、綠膿菌素、變形菌素和弧菌素等。
（7）維生素。