肝臟由于接受肝動脈和門靜脈的雙重血液供應,并通過膽道豐富的血供和單核-巨噬細胞系統強大的吞噬作用,可以殺滅入侵的細菌并阻止其生長,因而細菌性肝膿腫發生率并不高。當人體抵抗力弱時,入侵的化膿性細菌可能會引起肝臟感染而形成膿腫。引起細菌性肝膿腫最常見的致病菌在成人為大腸埃希桿菌、變形桿菌、銅綠假單胞菌,在兒童為金黃色葡萄球菌和鏈球菌,而Friedlnder肺炎桿菌等則次之。