標本采集和運送是細菌和真菌培養成功的最最重要的關鍵！但由于標本的采集和運送常有護士或醫生或病人自己完成,所以也是最不容易做好的事情，而且不知道問題所在之處，由此引發的最主要后果是陽性率下降，這也是臨床醫生最不能接受的問題. 因此,臨床微生物檢驗標本采集應規范化, 有助于臨床合理使用抗菌藥物.
表1血和脊髓
標本類型
| 采集
| 時間和溫度
| 重復采樣限制 | 說明
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原則 | 裝置和最小量
| 轉運
| 儲存 | |||
血培養 | 最佳采血時間：盡可能在抗菌藥物使用前，盡可能在寒顫和發熱初起時。
培養瓶的消毒：棄去瓶頂塑料帽,用75%乙醇棉球消毒瓶頂橡皮塞,待干60秒。
靜脈穿刺消毒：嚴格按照皮膚消毒步驟操作（建議使用洗必泰）。
血液培養必須特別注意消毒，避免皮膚表層細菌造成污染。
采得的血首先應打入需氧瓶，然后再打入厭氧培養瓶，有利于更好地分離出真菌、綠膿桿菌和嗜麥芽窄食單胞菌。 | 成人：8~10ml/瓶. 新生兒：1～3ml/瓶.
常規血培養應該包括至少一個需氧培養瓶和一個厭氧培養瓶（稱“1套”）。
一些數據顯示，另加一個厭氧瓶比僅僅是用需氧瓶的效果好. | ≤2 h，常溫，禁止冰箱保存。
| ≤24h，常溫，，禁止冰箱保存。
| 3套/24h
| 急性膿毒病：10min內從不同的部位采集2-3套。 急性心內膜炎：1-2h從3個分離部位采3套。
亞急性心內膜炎：從不同部位采3套，間隔15min，如24h內為陰性，要再采3 套。
原因不明發熱：從不同部位采2-3套，間隔≥1h，如24h內為陰性，須再采3套。 |
主要病原菌： 沙門菌、布氏桿菌、其他革蘭陰性桿菌、金黃色葡萄球菌、肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌。 以下菌應視為非病原菌（除非大于1次血培養分離出）：
芽孢桿菌屬、凝固酶陰性葡萄球菌、草綠色鏈球菌、棒狀革蘭陽性桿菌
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脊髓
| 注意無菌操作
| 接種血培養瓶≥1ml
| ≤2h，常溫，禁止冰箱保存。 | ≤24h，常溫，禁止冰箱保存。 | 1/d | 少量脊髓可直接接種培養基
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培養瓶種類：未用過抗菌藥物的需氧培養瓶（蘭色）；
未用過抗菌藥物的厭氧培養瓶（紫色）；
用過抗菌藥物的需氧培養瓶（綠色）；
用過抗菌藥物的厭氧培養瓶（棕色）；
兒童需氧培養瓶（黃色）