需要知道DNA濃度、DNA片段長度。即可換算成拷貝數
1A260 吸光度值=ds DNA 50 ug/ml=ss DNA 33 ug/ml=ss RNA 40 ug/ml
核酸濃度=(OD260) x (dilution factor) x [33 或40或50]= ng/ul
MW 代表 克/摩爾,單位dolton:1dolton即表示 1g/mol
1 摩爾= 6.02 x 10(23)次摩爾分子(拷貝數)
平均分子量(MW):
dsDNA=(堿基數) x (660 道爾頓/堿基)
ssDNA=(堿基數) x (330 道爾頓/堿基)
ssRNA=(堿基數) x (340 道爾頓/堿基)
得到拷貝數計算公式:
(6.02 x 10(23)次拷貝數/摩爾) x (濃度) / (MW g/mol) = copies/ml.
即:
(6.02 x 10(23)) x (g/ml) / (DNA length x 660) = copies/ml.
或
(6.02 x 10(23)) x (ng/ul x 10(-9) ) / (DNA length x 660) = copies/ul.
總之,如果DNA/RNA的量是ng/ul,那么拷貝數(copies/ul)=[(ng數×10的-9次方)×(6.02×10的23次方)]÷(堿基數×345)
例:
3000 堿基質粒,濃度100 ng/ul ,MW= 3000 bp x 660 dalton/bp =1.98 x 10(6) daltons,即1 mol =1.98 x 10(6) g。
[ 100ng x 10(-9) ] g / 1.98 x 10(6) = 摩爾數 copy數= 摩爾數 x 6.02 x 10(23)= 3x 10(10) copies/ul.
1。通過序列推算出該質粒的分子量2。測出溶液的濃度3。算出摩爾濃度,得到拷貝數......
拷貝數變異(Copynumbervariation,CNV)是由基因組發生重排而導致的,一般指長度為1kb以上的基因組大片段的拷貝數增加或者減少,主要表現為亞顯微水平的缺失和重復。CNV是基因組結構變......
近日,中科院上海生科院計算生物學研究所徐書華研究組與國內外科學家合作,檢測到一段藏族特異的拷貝數缺失區域,有可能解決困擾科學家多年的高原極端環境生物學適應機制問題。相關研究已在線發表于《美國人類遺傳學......