當3個月以內嬰兒出現出血癥狀時，根據喂養史，所患疾病及使用藥物史，應首先考慮本病。若應用維生素K后，出血癥狀于24小時內迅速改善，凝血酶原時間恢復正常，則可以確定診斷。
若本病僅出現顱內出血癥狀，而不伴有其他部位出血表現時，易誤診為顱內感染如腦炎、腦膜炎等疾病。本病起病突然，病前無明顯感染中毒癥狀，貧血發展迅速而嚴重，腦脊液呈血性，結合實驗室檢查與對維生素K治療的反應，均有別于顱內感染性疾病。
此外，尚需與先天性凝血因子缺乏性疾病如血友病等鑒別，后者有反復出血史，或家族成員中有類似病史，以及各病特有的實驗室檢查特點，可資鑒別。
診斷：多見于3個月以內的嬰兒，人乳喂養者占多數，病前多有腹瀉、服用廣譜抗生素或磺胺類藥的病史。
常突然出現自發性出血，如皮膚出血點、瘀斑、皮下血腫，尤以受壓部位如背部、腰骶部、臀部多見。常見注射部位出血不止、鼻衄、消化道出血等。
嚴重者發生顱內出血，多見蛛網膜下腔、硬膜下出血，腦室、腦實質出血少見。顱內出血可不伴有其它部位出血而單獨發生。可出現腦膜刺激征、急性顱內壓增高征及血腫壓迫腦組織所致神經定位癥狀。甚至出現腦疝、呼吸衰竭死亡。其它臨床癥狀可有貧血、肝腫大、發熱等。