GFP是一個分子量較小的蛋白，易與其他一些目的基因形成融合蛋白且不影響自身的目的基因產物的空間構象和功能。GFP 與目的基因融合，將目的基因標記為綠色，即可定量分析目的基因的表達水平，顯示其在腫瘤細胞內的表達位置和量的變化，為探討該基因在腫瘤發生、發展中的作用及其分子機制提供便利條件。
在腫瘤的形成過程中，增殖和凋亡是一對相互矛盾的統一體。若腫瘤細胞凋亡占優勢，腫瘤組織將長期處于休眠狀態或自行消亡。腫瘤細胞的凋亡受凋亡相關基因調控。用GFP轉染腫瘤細胞凋亡相關基因，并與正常組織進行比較，則大致可判斷此基因為抑制腫瘤細胞凋亡的基因；反之，為促進腫瘤細胞凋亡的基因。
腫瘤細胞浸潤是腫瘤細胞粘連、酶降解、移動和基質內增殖等一系列過程的表現，其根本原因在于腫瘤細胞內某些基因表達異常。利用GFP 的示蹤特性，研究腫瘤細胞內某些基因異常表達與腫瘤細胞浸潤的關系，即可揭示腫瘤細胞浸潤的某些機制。