美國華人質譜會CASMS第3日精彩繼續

美國東部時間2022年10月19日，第二屆美國華人質譜學會（CASMS）學術研討會暨展覽會在Gather Town繼續第三天的進程。本屆會議以“Advancing Biological and Pharmaceutical Mass Spectrometry”（推動質譜在生物與藥物領域的技術應用發展）為主題，共邀請超過60位來自美國、加拿大、中國、荷蘭以及新加坡等國家的科研學界以及工業界的杰出研究人員帶來精彩演講。分析測試百科網作為會議支持媒體全程為您報導。

TSMS特別研討會

TSMS特殊研討會邀請到了三位生物細胞領域的專家，他們在細胞外囊泡膜蛋白和靶向分析、臨床代謝組學、植物調控機制等方面各有自己的建樹。

報告題目：Extracellular vesicle membrane protein profiling and targeted mass spectrometry unveil novel plasma biomarkers for detection of colorectal cancer

報告人：臺灣長庚分子藥物研究中心主任 Jau-Song Yu教授

結直腸癌是臺灣2016年患病最多的癌癥，一年共有15000例病例。癌胚抗原（CEA）作為及直腸癌的標志物已被廣泛應用，但作為1-2期大腸癌的敏感性仍不夠。Jau-Song Yu教授設計了大腸癌細胞系EVs的膜蛋白組分析流程，基于AIMS和iTR AQ的血漿EVs的蛋白質組學分析從混合樣本分離，通過靶向MS分析在個體血漿來源EV中對雪頂靶點進行定量篩查。

報告題目：Development of mass-spectrometry based methods for metabolomic studies and clinical applications of metabolomics

報告人：臺灣國立大學藥學院 Ching-Hua Kuo教授

代謝組學是研究現代生命科學的重要方法，不僅可以應用于臨床治療、疾病診斷、微生物組，還可以應用在毒理學藥理學研究、個性化營養學等領域。Ching-Hua Kuo基于MIIS的細胞濃度條件方法工作流程，規范了細胞代謝組學研究就，保證了數據的完整性。該方案已經用于乳腺癌新型輔助化療、帕金森癥分析等。

報告題目：Integrated MS-Based OMICs approaches on revealing the regulation mechanism of plant immunity by peptide cytokines

報告人：臺灣農業生物技術研究中心 Yet-Ran Chen

植物細胞在受到細菌分子信號后，如何移動信號引起免疫反應產生PR1的機制仍未被闡明。Yet-Ran Chen介紹了以擬南芥中DIA肽組化合物的分析流程為基礎，對細胞感染后的植物體內的信號傳導進行了研究。

專題講座：精準醫學中的蛋白組學

報告題目：Next Generation Translational Proteomics of Alzheimer‘s Disease

報告人：美國華盛頓大學 Michael J. MacCoss教授

阿爾茨海默癥的神經病理學評估有助于科學家進一步對阿爾茲海默癥研究。Michael J. MacCoss教授利用高位蛋白質組學數據來檢測和了解三組阿爾茨海米癥分子特征，包括法善性和常染色體顯性遺傳性AD差異；癡呆伴AD神經病理性改變的恢復能力；在疾病神經病理學中缺乏共病的蛋白組學研究。

報告題目：Diagnosing Thyroid Nodules with AI-Empowered Proteomics

報告人：西湖大學iMarkers實驗室主任/生命科學學院蛋白組大數據實驗室 Tiannan Guo副教授

甲狀腺結節是指在甲狀腺內的腫塊，可隨吞咽動作隨甲狀腺而上下移動，是臨床常見的病癥，并有著龐大的患病群體。目前甲狀腺濾泡性腫瘤在手術前還無法鑒別。為了解決這個問題，Tiannan Guo基于蛋白質分析發展了首款用于甲狀腺結節診斷的AI賦能蛋白質分類器。

報告題目：Probing RNA-Protein Interaction by Mass Spectrometry

報告人：天津醫藥科學與技術學院 Ruiding Chen教授

RNA和蛋白之間的相作用不僅是RNA指導蛋白質合成，蛋白質調節RNA加工和翻譯活動，除此RMA還可以于蛋白結合共同完成功能。Ruiding Chen介紹了IncRNAs的作用機制，并介紹了TOBAP-MS用于RNA親和純化以便定量分析的方法。方法揭示了IncRNA-蛋白質相互作用在癌癥調控中的功能。

報告題目：Integrative Omics Analysis to Provide New Insights into Cancer Biology

報告人：太平洋西北國家實驗室 Tao Liu高級研究員

蛋白質基因組學為癌癥診斷和治療提供了信息。Tao Liu使用集成于質譜的“批量”蛋白質組學工作流程，收集了不同癌癥的數據信息，并利用機器學習識別腫瘤的個體表型。繼承的PTM和多組學分析平臺為大規模多組體腫瘤表征提供了強大、全面、多方面的數據，有助于對癌癥生物學的新認識。

報告題目：High-throughput analysis of ADME proteins in plasma extracellular vesicles for clinical surveillance

報告人：瑞輝公司高級科學家 Xiaofeng Wu

藥物ADME檢測在臨床治療學中主要在人肝臟組織、肝臟線粒體和細胞裂解物中。Xiaofeng Wu所在的輝瑞公司建立了一個具有高通量的研究血漿細胞外囊泡中的ADME蛋白質的工作流程。

報告題目：Application of Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry to the Clinical Practice of Hemoglobin Variant Identification

報告人：美國斯坦福大學臨床化學副主任 Ruben Y. Luo助理教授

Ruben Y. Luo介紹了臨床實驗室流水線化的工作研究模式，以及從基礎研究到臨床研究的過程中的轉化研究。Ruben Y. Luo團隊構建了毛細管電泳-質譜（CE-MS）方法，將質譜接入毛細管電泳接口，使用血紅蛋白為研究對象對CE-MS的性能進行測試，而且已經有一些成功的臨床實驗案例。

專題講座：小分子、蛋白質和新模式生物轉化科學的最新進展

報告題目：Strategies and Toolkits for Assessing the Metabolic Stability and Biotransformation of Macrocyclic Peptides in Drug Discovery

報告人：Mersana Therapeutics高級總監 Dian Su

想要理解大肽環（MCP）生物轉化的策略和方法，需要了解體外分析所用基質；MCP哪些結構特征影響腸道穩定性；主要代謝酶是什么；生物轉化如何指導MCP的設計以提高穩定性。Dian Su詳細介紹了這四方面的工作，研究了MCP的代謝途徑，找了MCP需要的如：CYP、肽酶等廣譜酶，并發現MCP在不同器官、基質和物種的代謝速率有所區別。

報告題目：LC-MS Approaches for Monitoring Biotransformation of Novel, Complex Biotherapeutics

報告人：GSK 副創意總監兼GSK研究員 John F. Kellie

高分辨率LC-MS分析可以用于藥代動力學關鍵監測：從藥物在生物體內的轉化和改性到關鍵質量屬性（CQA）的測試。這將有助于藥物研究中改進分子設計、提高競爭優勢、幫助推動項目進展。GSK主要研究在臨床前模型中純化的生物藥物并表征可能影響PK或療效的任何分子變化，通過基于血清的免疫捕捉利用LC-MS獲得肽的完整信息，在最終確認前消除潛在的不良候選藥物。

報告題目：Microbe-host Interplay in the Biotransformation of Inulin Polysaccharide Revealed by Stable Isotope Tracing

報告人：蘇州大學 Deng Pan教授

糖類藥物主要可用于抗菌、抗腫瘤、抗炎癥等藥物，并在中國有著很大的藥物基數。Deng Pan團隊使用SIRM技術，確定了以¹³C-多糖為第五的腸道微生物產生的代謝產物。這種方法提供了一個更好的了腸道微生物生態產物的形成。確定微生物區系代謝特征有助于了解微生物群于宿主信息傳遞和個性化的管理腸道微生物以獲得功能。

報告題目：A High-throughput Acyl Glucuronide Stability Assay Based on ¹⁸O-Labeling

報告人：Gilead Sciences 研究科學家 Josh Yu

酰基化葡萄糖醛酸苷可增加特異性藥物的毒性風險。Josh Yu標記用¹⁸O標記了酰基葡萄糖苷，并借助超高效液相色譜獲得其酰基遷移動力學證據。

報告題目：Unexpected Cyanide Release and Species Differences of GDC-0919 in Rats, Dogs, and Human

報告人：基因泰克（Genentech）高級科學家 Shuai Wang

GDC-0919是有效的吲哚胺2,3-雙加氧酶（IDO）抑制劑。Genentech研究了GDC-0919氰化物釋放的代謝途徑和意義，并首次報道了稠合咪唑的氰化學釋放代謝，并在藥物設計的角度查明了全新脫氰代謝物的藥理學和毒理學，并發現氰化物會有效轉化為硫氰酸鹽。

報告題目：Development of an Automated Immunoaffinity Purification Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry (IA-CE-MS) Intact Mass Workflow for Next Generation Biologics Biotransformation Studies

報告人：Amgen首席科學家 Mei Han

用于治療多種疾病的生物治療藥物的全球市場增長迅速，最新的蛋白質工程使開發具有高特異性靶向的多種方式。Mei Han介紹了Amgen的IA-CE-MS分析生物樣品的完整性質量分析方法，并用該流程監測兩種Fc-Fusion蛋白的單劑量藥代動力學研究中的蛋白質穩定性。