1.尿常規
鏡檢白細胞增多，若見白細胞（或膿細胞）管型，則提示病變在上尿路，紅細胞也可增多，血尿型者甚至為肉眼血尿，尿蛋白可增多，但一般<2.0g/d，多為小分子蛋白，腎小管功能受損時，可出現尿比重降低，晨尿pH增高。
尿白細胞排泄增加提示尿路炎癥，在診斷方面也具有重要意義，無癥狀菌尿癥時膿尿發生率約37%，白細胞排泄>5個/mm3即屬異常，膿尿與菌尿有極顯著的相關性，可作為最初的篩選方法，白細胞酯酶試紙法對預測鏡下菌尿和陽性尿培養的敏感性均為100%，如再結合鏡下膿尿，菌尿，其特異性亦達100%。
用抗生素或化療藥物治療，不久即可呈現無菌性膿尿，無菌性膿尿也是腎結核，結石，鎮痛劑濫用，少數需氧菌和厭氧菌感染的表現，尿路損傷如衣原體尿道炎，腎小球腎炎和腎病等也可見無菌性膿尿。
不伴膿尿的尿路感染見于藥物和再生性障礙等引起的白細胞減少癥，腎臟集合系統遠端感染性病變（如腎皮質膿腫），偶見于梗阻性尿路病。
白細胞尿不是尿路感染恒有的特點，連續幾次的尿標本白細胞計數變化不定，單次尿標本查不到白細胞不應視為無菌尿的證據，膿尿取決于尿液流量和尿pH值，一天之內尿細菌計數也可不同，一般來講，宜查晨尿標本。
白細胞管型是上尿路炎癥性疾病可靠的證據，但與顆粒管型一樣并非感染所特有，活動性腎盂腎炎時常見不到這些管型，做管型計數時須用新鮮尿標本。
鏡下血尿不是提示細菌感染的可靠證據，無蛋白尿不能排除尿路感染，大多數尿路感染病人尿蛋白排泄低于2.0g/24h。
2.尿細菌檢查
有意義菌尿是指徑直接取得（膀胱穿刺）的膀胱尿證實有細菌繁殖（不管計數多少）或取中段尿培養計數大于105/ml，當有尿路梗阻，頻繁排尿，標本采取不當以及使用抗生素時均可影響培養結果，但如連續3次均得到相同的結果時，其診斷價值將從單次的80%增加到95%以上，尿菌定量培養結果評定標準是尿含菌數大于105/ml為陽性，小于104/ml為污染，介于104～105/ml之間需復查或結合臨床綜合考慮作出診斷，但球菌繁殖速度較慢，尿含菌數達103～104/ml，已有診斷意義，根據臨床需要，除作普通菌培養外，高度懷疑原漿型菌株可作高滲培養，這可提高L型菌株培養陽性率，對多次尿普通菌培養陽性的慢性腎盂腎炎的診斷有重要意義，L型細菌是沒有固體細胞壁的細菌，細菌接觸到損傷其表面的物質，如抗生素或抗體-補體-溶菌酶后可轉變成L-型細菌，腎髓質的高張力狀態有利于其存活，L-型細菌毒力較低，轉為正常細菌后毒力可恢復正常，必要時尚可作厭氧菌培養，真菌培養，培養陽性時應作藥物敏感試驗，以指導臨床選擇抗菌藥物，不離心尿若直接鏡檢發現每個高倍鏡下有1個細菌，對判斷有意義菌尿也有100%的特異性和78%的敏感性，本法簡便，陽性率高，并可確定是桿菌抑或球菌，是革蘭陽性抑或陰性，這對及時選用有效藥物治療很有參考價值。
尿液標本留取的方法直接影響診斷的準確性，晨起第1次中段尿仍有首選方法，其次為導尿法和恥骨上膀胱穿刺取尿，但40%～60%的老年人存有輕重不一的尿失禁，可采用外套管收集標本，該方法與導尿法比較有100%的敏感性和94%的特異性，標本留取后不立即培養時應置入冰箱保存，尿標本在室溫放置2h以上細菌即可增殖。
3.尿細胞計數
近年多應用1h尿細胞計數法，其評判標準為白細胞30萬/h為陽性，小于20萬/h為陰性，介于20萬～30萬/h需結合臨床判斷，尿細胞計數常用于本病慢性期，尤其尿常規無明顯異常，多次尿培養無陽性結果，又無特異臨床表現者。
4.血常規檢查
急性期血白細胞計數和中性粒細胞可增高，慢性期紅細胞計數和血紅蛋白可輕度降低。
5.血清學檢查
較有臨床意義的為：
①尿抗體包裹細菌檢查，在熒光鏡下觀察用熒光素標記的抗人體蛋白抗體處理的尿細菌，若表面有抗體包裹則大多屬于腎盂腎炎，有助于尿路感染的定位診斷。
②鑒定尿細菌的血清型，有助于區分再發性腎盂腎炎的性質，若再發時與前次為同一血型則屬復發，而2次為不同血清型者為重新感染。
6.腎功能檢查
慢性期可出現持續性功能損害：
①腎濃縮功能減退如夜尿量增多，晨尿滲透濃度降低。
②腎酸化功能減退如晨尿pH增高，尿HCO3-增多，尿NH4+減少等。
③腎小球濾過功能減退如內生肌酐清除率降低，血尿素氮，肌酐增高等。
7.X線檢查
對慢性或久治不愈者，視需要分別可做尿路平片，靜脈腎盂造影，逆行腎盂造影，排尿時膀胱輸尿管造影，以檢查有無梗阻，結石，輸尿管狹窄或受壓，腎下垂，泌尿系先天性畸形以及膀胱輸尿管反流現象等，此外，還可了解腎盂，腎盞形態及功能，借以與腎結核，腎腫瘤鑒別，慢性腎盂腎炎的腎盂呈輕度擴張或杵狀，并可有瘢痕性畸形，腎功能不全時需用2倍或3倍劑量碘造影劑作靜脈快速滴入，此項檢查可能加重腎功能進一步惡化，請注意并多次攝片才能使造影得到滿意效果，腎血管造影可顯示慢性腎盂腎炎的小血管有不同程度的扭曲，必要時可作腎CT掃描或核磁共振掃描，以排除其他腎臟疾患。
8.同位素腎圖檢查
可了解腎功能，尿路梗阻，膀胱輸尿管反流及膀胱殘余尿情況，急性腎盂腎炎的腎圖特點為高峰后移，分泌段出現較正常延緩0.5～1.0min，排泄段下降緩慢；慢性腎盂腎炎分泌段斜率降低，峰頂變鈍或增寬而后移，排泄段起始時間延遲，呈拋物線狀，但上述改變并無明顯特異性。
9.超聲波檢查
是目前應用最廣泛，最簡單的方法，它能篩選泌尿道發育不全，先天性畸形，多囊腎，腎動脈狹窄所致的腎臟大小不勻，結石，腎盂重度積水，腫瘤及前列腺疾病等。