(1) 扭轉痙攣應與舞蹈癥、僵人綜合征（stiff-man syndrome）鑒別：扭轉痙攣與舞蹈癥的鑒別要點是舞蹈癥的不自主運動速度快、運動模式變幻莫測、無持續性姿勢異常，并伴肌張力降低，而扭轉痙攣的不自主運動速度慢、運動模式相對固定、有持續性姿勢異常，并伴肌張力增高。僵人綜合征表現為發作性軀干肌（頸脊旁肌和腹肌）和四肢近端肌緊張、僵硬和強直，而面肌和肢體遠端肌常不受累，僵硬可明顯限制患者的主動運動，且常伴有疼痛，肌電圖檢查在休息和肌肉放松時均可出現持續運動單位電活動，易與肌張力障礙區別。
(2) 痙攣性斜頸需與頭部震顫、先天性斜頸相鑒別：先天性斜頸發病年齡早，可因胸鎖乳突肌血腫后纖維化，頸椎的先天缺如或融合，頸肌肌炎、頸淋巴結炎及眼肌麻痹（如上斜肌麻痹）等所引起。因痙攣性斜頸常會出現陣發性不自主痙攣，類似頭部震顫，需與原發性震顫、帕金森病相鑒別。
(3) Meige綜合征應與顳下關節綜合征、下頜錯位咬合、面肌痙攣、神經癥相鑒別：面肌痙攣表現為一側面肌和眼瞼的抽搐樣表現，不伴有口-下頜的不隨意運動。
(4) 在明確肌張力障礙診斷后要盡量尋找病因：原發性肌張力障礙除可伴有震顫外，一般無其他陽性神經癥狀和體征。起病時即為靜止性肌張力障礙、較早出現持續的姿勢異常、語言功能早期受累、起病突然、進展迅速以及偏側肌張力障礙均提示為繼發性，應積極尋找病因。若伴有其他神經系統癥狀和體征，如肌痙攣、癡呆、小腦癥狀、視網膜改變、肌萎縮和感覺癥狀等，也提示繼發性肌張力障礙。
繼發性肌張力障礙的篩查手段包括：頭顱CT或MRI（排除腦部器質性損害）、頸部MRI（排除脊髓病變所致頸部肌張力障礙）、血細胞涂片（排除神經-棘紅細胞增多癥）、代謝篩查（排除遺傳性代謝疾病）、銅代謝測定及裂隙燈檢查（排除Wilson 病）。對兒童期起病的扭轉痙攣還可進行DYTl基因突變篩查