1992年第一份肌鈣蛋白I商業檢測試劑在臨床推廣，不久肌鈣蛋白T檢測試劑也開始在臨床應用，在隨后十余年引發了一場曠日持久的大爭論—到底肌鈣蛋白T和肌鈣蛋白I孰優孰劣？
早期曾有研究觀察到在慢性腎功能衰竭患者中經常出現肌鈣蛋白T增高卻不一定有急性冠脈綜合癥。隨后提出了幾個可能的學說：（1）慢性腎功能衰竭患者中肌鈣蛋白T在橫紋肌表達再分布，（2）抗原交叉反應，（3）慢性腎功能不全引發心肌微損害有關。
第一個假說很快被cTnT陣營否定，有學者用PCR檢測否定cTnT在慢性腎功能衰竭患者表達異常。隨著第二代肌鈣蛋白T檢測方法推出抗原交叉反應得到較好解決。慢性腎功能不全心肌微損害也同樣會引起肌鈣蛋白I增高。
目前傾向認為肌鈣蛋白I和肌鈣蛋白T在心梗診斷敏感性和特異性上沒有很大區別，但是相對而言，有個問題顯得更加重要，無論是cTnT或cTnI，自肌鈣蛋白檢測方法問世以來，沒有經過一個壟斷的ZL生產過程。不同廠家、不同免疫檢測方法，可謂五花八門，始終未能形成一個統一全球質量標準，只有企業質量標準。不同廠家試劑盒可比性較差，甚至無法比較。這可能成為兩大陣營論戰當中諸多結論相互矛盾主要原因。由于巨大的市場份額和不同商業利益，要求不同廠家按照統一模式生產出目前看來并不現實。這樣看來我們確實不必要花太多精力一定要在cTnT和cTnI之間分出伯仲。