腸球菌為革蘭陽性，成雙或短鏈狀排列的球菌、卵圓形，無芽胞，無莢膜，部分腸球菌有稀疏鞭毛。營養要求高，需氧及兼性厭氧菌，最適生長溫度35℃。
與同科鏈球菌的顯著區別在于腸球菌能在高鹽（6.5%NaCl）、高堿（pH9.6）、40%膽汁培養基上和10℃～45℃環境下生長，并對許多抗菌藥物表現為固有耐藥。觸酶試驗陰性，在膽汁七葉苷和含6.5%NaCl培養基中可以生長，此點可與鏈球菌鑒別。
