GALT富含淋巴細胞，主要分布于淋巴結、固有層和腸上皮細胞間。固有層中CD4+與CD8+淋巴細胞的比例與其在周圍器官比例相似，固有層中的T細胞都表達TCRαβ，這些細胞在抗原刺激后僅能產生很弱的增殖過程，但卻能分泌大量的細胞因子，如 INF-γ、IL-4和IL-5等。表明這類淋巴細胞是受到持續抗原刺激，多為晚期分化的效應細胞。IEL散布于腸上皮細胞間，80%以上為CD8+T細胞，其中相當數量為TCRγδT細胞。IEL可能需經特殊途徑活化或 IEL已是充分分化的效應細胞。
