腸道桿菌（Enteric bacilli)是一大群寄居于人和動物腸道中的革蘭氏陰性無芽胞內桿菌,常隨人與動物糞便排出,廣泛分布于水、土壤或腐物中。
腸道桿菌屬于腸桿菌科（Enterobacteriaceae)，分類尚未完全統一，過去主要依據生化反應和抗原結構進行分類。近十多年來，應用DNA同源性研究、抗生素敏感譜、種和型特異性噬菌體，以及電子計算機分析技術等，使其分類日趨合理。目前腸桿菌科至少有25個菌屬，90個以上菌種、生化群和血清群，其中與醫學關系較密切者見表。
表9-1 腸桿菌科中與醫學有關的細菌
屬 | 代表種 | 致病性 |
| 埃希氏菌屬（Escherichia) | 大腸埃希氏菌(E.coli) | 腸道外感染，急性腹瀉 |
| 志賀氏菌屬（Shigella) | 痢疾志賀氏菌(Sh.dysenteriae) | 細菌性痢疾 |
| 愛德華氏菌屬（Edwardsiella) | 遲純愛德華氏菌(E.tarda) | 蛇類等血動物的正常腸道寄居菌，偶見于健康人或腹瀉者糞便內 |
| 沙門氏菌屬（Salmonella) | 傷寒沙門氏菌(S.typhi) | 腸熱癥、急性腸炎、敗血癥 |
| 枸櫞酸桿菌屬(Citrobacter) | 弗勞地氏枸櫞酸桿菌(C.freundii) | 條件致病菌，引起繼發性感染 |
| 克雷伯氏菌屬(Klebsiella) | 肺炎克雷伯氏菌(K.pneumoniae) | 肺炎，泌尿系、創傷感染，敗血癥等 |
| 腸桿菌屬(Enterobacter) | 產氣桿菌(E.aerogenes) | 很少引起原發性感染 |
| 哈夫尼亞菌屬(Hafnia) | 蜂窩啥夫尼亞菌(H.alvei) | 對人無致病性 |
| 沙雷氏菌屬(Serrati) | 粘質沙雷氏菌(S.marcescens) | 條件致病菌，引起泌尿系，呼吸道及創傷感染 |
| 變形桿菌屬(Proteus) | 普通變形桿菌(P.vulgaris) | 食物中毒，泌尿系、呼吸道感染 等 |
| 耶爾森氏菌屬 (Yersinia) | 鼠疫耶爾森氏菌 (Y.pestis) | 鼠疫 |
| 歐文氏菌屬(Erwinia) | 草原居民歐文氏菌(E.herbicola) | 植物寄生菌，曾從人體腸道及化膿扁桃體中分離到 |
耶爾森氏菌具有腸道桿菌科的共性，有腸道桿菌的共同抗原，與大腸桿菌、沙門氏菌、變形桿菌呈現血清學交叉反應。為編排方便起見，放入動物源性病原菌中講授。
大多數腸道桿菌是腸道的常居菌，當人體免疫力低下或細菌侵入腸道以外部位時，也可引起疾病，故為條件致病菌。有些細菌為致病菌，如傷寒桿菌、痢疾桿菌、致病性大腸桿菌等，引起人類腸道疾病。
腸道桿菌具有下述共同特性：
1．形態與結構：中小等大小兩端鈍圓的革蘭氏陰性桿菌，無芽胞，多數有鞭毛，大多有菌毛，少數有莢膜或包膜。
2．培養特性：需氧或兼性厭氧菌，在普通培養基上生長良好，為中等大小的光滑型菌落。有些菌在血瓊平板上出現β型溶血，在液體培養中呈均勻混濁生長。
3．生化反應：生化反應活潑，一般說來，生化反應的強弱與其致病作用成反比。乳糖發酵試驗在初步鑒別腸道致病和非致病菌時有重要意義，前者一般不分解乳糖，而非致病菌多數能分解乳糖。
4．抵抗力：不強，加熱60℃經30分鐘即死亡。膽鹽、煌綠等對大腸桿菌等非致病菌有選擇性作用，可制備腸道桿菌選擇性培養基以分離腸道致病菌。
5．變異：易出現變異菌株。最常見的是耐藥性轉移、毒素產生和生化反應等的改變。這在致病力、細菌學診斷、治療與預防中均有重要意義。
6．致病物質：內毒素是腸道桿菌的主要致病物質。部分腸桿菌產生外毒素致病。
7．傳播方式：污染的飲水及食物、經消化道傳播。