肽的溶解性及儲存
肽的疏水性
氨基酸可以根據其其側鏈的性質歸類如下:
非極性氨基酸(疏水性)
小的:Cys、Pro、Ala、Thr
大的:Val、Ile、Leu、Met、Phe
中性氨基酸 大的:Trp、Tyr、His
極性氨基酸(親水性)
小的:Ser、Gly、Asp、Asn
大的:Glu、Gln、Lys、Arg
可溶性的問題
許多合成的肽粗品,尤其是那些經過幾次沉淀和干燥的,在標準的HPLC溶劑中十分難溶,原因為:
含有大量的疏水性殘基,它們會象油一樣緊密的擁成一簇,以減少與水的接觸并增大 分子之間的疏水性作用。
非特異性的聚集。
含有Cys的肽中形成二硫鍵。
二級結構的形成,特別是較長的分子。
活性側鏈(包括各種類型的氫鍵、鹽橋等)之間的特異性相互作用
肽的溶解
以下幾種操作可以用來溶解肽(二硫鍵是一種共價的相互作用,應該盡量還原):
對于含有芳香或者烴側鏈的氨基酸(Val、Leu、Ile、Met、Phe、Tyr、Ala),加入DMF至50%溶解;或者加入最少量的DMF,然后用緩沖液稀釋即可。但應當注意有機溶劑對于后續試驗的影響。
如果含有較多的堿性氨基酸,可以用醋酸的水溶液(1-10%)進行溶解。
如果含有酸性的氨基酸,可以用揮發性的堿性緩沖液(pH可以達到8)如乙酸乙脂嗎啉或重碳酸鹽等溶解。
如果序列比較長,有可能溶解于鹽溶液。高濃度的離液鹽,如鹽酸胍或脲等可以通過破壞其二級結構而幫助其溶解。
對于中等大小的分子,丙醇可以加速溶解。
少量的TFA可以幫助溶解聚集物
可以加入去垢劑(如SDS)進行處理,但是需要注意的是含有聚醚的去垢劑可能會產生過氧化物從而損害某些肽。可從公司訂購非過氧化去污劑。
多肽的保存:
大多數多肽可以保存在-20℃,特別是冷凍干燥并保存在干燥器中,能夠在-20℃的條件下保存兩年而沒有問題。在將它們暴露于空氣之前, 冷凍的多肽和容器應當至少在室溫中放置30min以上時間,然后取用。這將避免多肽樣品吸收潮氣。當無法冷凍干燥時,最好的方法是以小的工作樣量存放。
對于含Cys, Met or TrP的多肽,很容易受到空氣中的氧氣和溶解試劑的氧的影響而氧化。因此,避免此類多肽和氧接觸是很重要的。對其溶解時脫氧緩沖溶劑是必不可少的,在封瓶前,慢慢流過多肽的氮氣或氬氣也會降低氧化作用。