細胞壁的信號傳導：肽聚糖是細胞壁的主要成分，它可以作為信號分子，與細胞內的受體蛋白相互作用，從而調控細胞的生長、分裂和其他生理過程。例如，在原核生物中，肽聚糖合成過程中產生的信號分子（如胞外多糖）可以與細胞骨架的其他組成部分相互作用，從而調控細胞的生長、分裂和其他生理過程。
與細胞內信號傳導蛋白相互作用：肽聚糖可以與細胞內的特定信號傳導蛋白相互作用，從而影響細胞的信號傳導過程。例如，在原核生物中，肽聚糖合成過程中產生的信號分子（如胞外多糖）可以與特定的信號傳導蛋白（如酪氨酸激酶）相互作用，從而調控細胞的生長、分裂和其他生理過程。
參與免疫反應：肽聚糖是細菌細胞壁的主要成分，它可以被免疫系統識別為外來抗原，從而觸發免疫反應。在這個過程中，肽聚糖可以與特定的免疫細胞（如巨噬細胞和中性粒細胞）相互作用，從而調控免疫反應的強度和方向。
參與炎癥反應：肽聚糖可以與特定的炎癥介質（如白介素和腫瘤壞死因子）相互作用，從而調控炎癥反應的強度和方向。在這個過程中，肽聚糖可以與免疫細胞（如巨噬細胞和中性粒細胞）相互作用，從而調控炎癥反應的強度和方向。