• <noscript id="yywya"><kbd id="yywya"></kbd></noscript>
  • 發布時間:2020-08-24 11:19 原文鏈接: 肽適配體的親和力成熟實驗

    實驗方法原理



    實驗材料 質粒 DNA酵母株

    試劑、試劑盒 Taq 聚合酶10×緩沖液引物 dATPdGTP dCTPdTTPMgCl2 MnCl2完全極限(CM) 缺失成分培養基和平板Xgal 平板

    儀器、耗材 PCR 管PCR 純化柱自動熱循環器 30℃ 培養箱

    實驗步驟

    實驗所需「材料」、「試劑」、「耗材」具體見「其他」


    1. 制備 PCR 預混合物(共 3.775 ml):

    500 ul 10×Taq 聚合酶緩沖液

    5 ul 1 mol/L MgCl2

    10 ul 100 mmol/L dATP

    10 ul 100 mmol/L dGTP

    50 ul 100 mmol/L dCTP

    50 ul 100 mmol/L dTTP

    125 ul 20 umol/L 引物 1

    125 ul 20 umol/L 引物 2

    2.9 ml 水


    2. 對每一個樣品,加入下列試劑到 PCR 管中:

    12 ul 水

    1 ul 肽適配體表達載體

    10 ul Mg2+/Mn2+ 溶液

    76 ul PCR 預混合物

    1 ul Taq 聚合酶(5 U)


    3. 用下列 PCR 反應程序進行擴增反應:

    4 個循環:

    30 s 95℃ (變性)

    1 min 55℃ (復性)

    1 min 72℃ (延伸)


    4. 移出 13 ul 反應混合液到一新的 PCR 管中,新管中預先吸入:

    10 ul Mg2+/Mn2+溶液

    76 ul PCR 預混合物

    1 ul Taq 聚合酶

    用同樣的 PCR 程序擴增。


    5. 重復總共 10 輪的擴增。


    6. 用 PCR 純化柱或瓊脂糖凝膠電泳純化 PCR 產物。


    7. 用 Ava II 消化純化的 PCR 產物,然后按照標準的亞克隆技術將其亞克隆到經 II 酶切過的 PJM-I1中。


    8. 用乙酸鋰酵母轉化法將 pBait 和 pBR1840 轉入 EGY48 中。在 10 cm Glu/CM-His、-Ura 平板上篩選轉化株。


    9. 用高效乙酸鋰方法將 10~50 ug 突變的肽適配體庫轉化含 pBait 和 pBR1840 的 EGY48。在 10 cm Glu/CM-His、-Ura、-Trp 平板上篩選轉化株。


    10. 收集轉化株,測定平板效率。


    11. 接種約 5 個庫等價物到 1 ml Gal/Raf/CM-His、 -Ura、-Trp 液體培養基中。于 30℃ 振蕩培養 4 h。


    12. 室溫下,于 3000 g 離心 4 min。棄上清,將酵母沉淀重懸于 1 ml 無菌水中。


    13. 將酵母涂布到 15 cm Gal/Raf/CM-His、-Ura、-Trp, X-gal 平板上,于 30℃ 培養至克隆出現(約 2 天)。


    14. 將藍色克隆劃線接種到一 10 cm Glu/CM-His、-Ura、-Trp 主平板上并于 30℃ 培養 1 天。


    15. 將主平板復印到 10 cm Gal/Raf/CM-His、-Ura、-Trp、X-gal 平板和 Glu/ CM-His、 -Ura、-Trp、X-gal 平板上。


    16. 從依賴半乳糖的藍色克隆中回收質粒并重新導入,含有 pBait 和 pBR1840 的酵母株 EGY48 中以再次驗證表型。


    17. 從依賴半乳糖的藍色克隆中回收質粒并對可變區進行測序。

     

    注意事項

    其他

    1. 材料

    質粒 DNA:肽適配體質粒,pBait,pJM-1, pRB1840(1-LexAop-LacZ 報道質粒)和 pJK103

    酵母株:EGY48 Mata ura3 trpl his3 3LexA-operator-leu2


    2. 試劑

    5 U/ul Taq 聚合酶和 10×緩沖液(Life Technologies)

    1 mol/L MgCl2

    100 mmol/L dATP

    100 mmol/L dGTP

    100 mmol/L dCTP

    100 mmol/L dTTP

    20 umol/L 引物 1: 5'-CCGCCGCCTGAATTCATGAGCGATAAAATTATTCAC-3'

    20 umol/L 引物 2: 5'-CGGGGCGATCATTTTGCACGGACC-3'

    Mg2+/Mn2+ 溶液:45 mmol/L ,MgCl2 和 5 mmol/L MnCl2

    PCR 純化柱(可選;如 Qiagen)

    完全極限(CM) 缺失成分培養基和平板,補加 2% (m/V) 葡萄糖 (Glu) 或 2% (m/V) 半乳糖和 1% im/V) 棉籽糖 (Gal/Raf):

    Glu/CM-His、-Ura (10 cm 平板)

    Glu/CM-His、-Ura、-Trp (10 cm 平板)

    Gal/Raf/CM-His、-Ura、-Trp (液體培養基)

    Xgal 平板

    Glu/CM-His, -Ura, -Trp, X-gal (10 cm 平板)

    Gal/Raf/CM-His, -Ura, -Trp, X-gal (10 cm 和 15 cm 平板)


    3. 耗材

    PCR 管

    自動熱循環器

    30℃ 培養箱


  • <noscript id="yywya"><kbd id="yywya"></kbd></noscript>
  • 东京热 下载