1.造血細胞：利用骨髓基質細胞或其條件培養液，可以誘導人胚胎細胞在體外分化為造血干細胞。
2.血管內皮細胞：人胚胎干細胞體外分化時，擬胚體的血島樣中前成紅細胞集落周圍也有內皮細胞出現。人胚胎干細胞衍生的擬胚體分化的管狀結構是由內皮細胞排列組成的，管道內還含有一些造血細胞，類似胚胎發育中的早期血管發生。
3.神經細胞：單層培養人胚胎干細胞的誘導分化實驗中在 RA 和雙丁酰基環腺磷酸共同作用下大部分的分化細胞為神經膠質細胞。
4.心肌細胞和其他肌肉細胞：懸浮或懸滴培養的人胚胎干細胞擬胚體在 RA 誘導下生長數天，常出現某些分化細胞集落具有節律性自發收縮現象，顯然是肌細胞。
5.脂肪功能：人胚胎干細胞分化成脂肪細胞，目前已有報道，但報道較少。
6.軟膏細胞：人胚胎干細胞分化成軟膏細胞的條件較為苛刻，一般成功率較低。