• <noscript id="yywya"><kbd id="yywya"></kbd></noscript>
  • 發布時間:2019-03-25 22:38 原文鏈接: 脈沖場凝膠電泳制備DNA(酵母完整DNA的分離)

    制備用于電泳的酵母 DNA,先用酶破壞酵母細胞胞壁,然后在熔化的低熔點瓊脂糖中混懸,制成栓。將栓浸入含蛋白酶的裂解緩沖液,以加速細胞裂解和除去蛋白質。此方法在 Schwartz 和 Cantor (1984) 最初介紹的方法上略有改進,它可用于制備作為 高分子質量標準的酵母染色體和酵母人工染色體(YAC)。本實驗來源「分子克隆實驗指南第三版」黃培堂等譯。


    實驗方法原理制備用于電泳的酵母 DNA,先用酶破壞酵母細胞胞壁,然后在熔化的低熔點瓊脂糖中混懸,制成栓。將栓浸入含蛋白酶的裂解緩沖液,以加速細胞裂解和除去蛋白質。此方法在 Schwartz 和 Cantor (1984) 最初介紹的方法上略有改進,它可用于制備作為 高分子質量標準的酵母染色體和酵母人工染色體(YAC)。
    實驗材料

    酵母混懸培養物

    試劑、試劑盒

    細胞清洗緩沖液EDTAL 緩沖液TE酵母裂解緩沖液酵母細胞壁消化酶酶解酶

    儀器、耗材

    低熔點瓊脂糖Sorvall GSA 轉頭或相當型號的轉頭預成型的 Plexiglas 模具

    實驗步驟

    一、材料

    1. 緩沖液和溶液

    細胞清洗緩沖液(0.01 mol/L Tris-Cl ( pH 7.6),0.05 mol/L EDTA ( pH 8.0),室溫存放。)

    EDTA ( 0.05 mol/L, pH 8.0)

    L 緩沖液(0.1 mol/L EDTA ( pH 8.0),0.01 mol/L Tris-Cl ( pH 7.6),0.02 mol/L NaCl,4℃ 存放)

    含蛋白酶 K 和十二烷基肌氨酸鈉(Sarkosyl) 的 L 緩沖液

    TE(pH 7.6)

    含 40 μg/ml PMSF 的 TE(pH 7.6)

    酵母裂解緩沖液(0.01 mol/L Tris-Cl(pH 7.6),0.5 mol/L EDTA(pH 8.0),β-巰基乙醇(1% V/V))

    酵母細胞壁消化酶

    酶解酶(Zymolyase)5000(Kirin Breweries)或溶細胞酶(Lyticase)(67 mg/ml)(Sigma)

    2. 凝膠

    低熔點瓊脂糖(1%)

    3. 離心機和轉頭

    Sorvall GSA 轉頭或相當型號的轉頭

    4. 專用設備

    預成型的 Plexiglas 模具(50~100 μl,Pharmacia 或 Bio-Rad), 或一個長的 Tygon 管(1/8 英寸或內徑 3.2 mm), 或一個塑料注射器(1 ml)。

    5. 細胞和組織

    酵母混懸培養物

    二、方法

    1. 3000 g ( Sorvall GSA 轉頭 4300 r/min) 4℃ 離心 5 min 收集混懸培養的酵母細胞。用細胞清洗緩沖液洗兩次細胞沉淀。

    2. 混懸細胞于 0℃ 的 0.05 mol/L EDTA(pH 8.0)中,濃度 3X109 個細胞/ml。

    3. 用 L 緩沖液配制 1% 低熔點瓊脂糖。熔化后,冷卻至 42℃。

    4. 加 75 μl 酶解酶或溶細胞酶溶液到步驟 2 的細胞混懸液內,混勻。

    5. 加熱細胞混懸液至 42℃。將 5 ml 熔化的瓊脂糖和 5 ml 細胞混懸液混合。用一個封口的巴斯德吸管攪勻混合物,以保證細胞完全分散在瓊脂糖中。

    6. 混合物移入預成形的 Plexiglas 模具(50~100 μl,Pharmacia 或 Bio-Rad), 或吸混合物到合適長度的 Tyson 管(內徑 3/32 英寸)內,也可以吸入 1 ml 塑料注射器內。室溫放置 15 min,再移至 4℃ 放 15~30 min。

    7. 瓊脂糖凝固后,從 Plexiglas 模具收集凝膠栓,或從 Tygon 管和注射器擠出凝膠。將圓柱形凝膠栓切成 1 cm 長的段。

    8. 3 倍體積酵母裂解緩沖液內 37℃ 溫育凝膠塊 3 h,化學通風櫥內進行。

    9. 干凈培養皿內加入 3 倍體積含有 0.1 mg/ml 蛋白酶 K 和 1% ( m/V)Sarkosyl 的 L 緩沖液。移入凝膠塊,50℃ 溫育 3 h。用新鮮等體積上述緩沖液替換舊的,繼續 50℃ 溫育 12~16 h。

    10. 在 50 倍體積含 40 μg/ml PMSF 的 TE ( pH 7.6) 50℃ 溫育凝膠塊 1 h。用新鮮等體積上述溶液替換舊的,繼續 50℃ 溫育 1 h。

    11. 除去含 PMSF 的 TE, 用新鮮等體積 TE ( pH 7.6) 室溫繼續溫育 1 h。



    相關文章

    里程碑式古基因組研究揭示人類進化的意外加速

    迄今規模最大的古代人類DNA研究表明,人類進化在過去1萬年里明顯加快。這項由美國哈佛醫學院的群體遺傳學家DavidReich聯合主導的研究,4月15日發表于《自然》。研究人員在涵蓋歐洲和中東地區的古代......

    DNA無錯率達99.1%!eMBS自動化糾錯平臺助力DNA合成

    近日,中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞中心與中國科學院天津工業生物技術研究所合作,研究開發了一種集成的、高靈敏度且高通量的錯誤校正平臺eMBS。能夠通過理性設計工程化MutS蛋白并結合磁珠分離......

    雙胞胎受審:DNA檢測能區分他們嗎?

    據報道,上個月法國發生的一起案件,在一把槍上發現了同卵雙胞胎兄弟的DNA,但他們擁有相同的DNA,所以傳統的DNA檢測方法,無法確定DNA屬于哪位兄弟。在法國一起刑事審判中,傳統的DNA檢測未能區分出......

    “寄生蟲”DNA片段會破壞癌癥基因組穩定性

    27日的《科學》雜志發表了一項研究,揭示了人類基因組中一類可“跳躍”的DNA片段——被稱為遺傳“寄生蟲”的LINE-1(L1)元件,如何成為破壞癌癥基因組穩定性的主要力量。基因組的不穩定正是癌癥演化的......

    古DNA技術揭示150年前沉船“生命史”

    一艘沉沒于150年前的船經歷了怎樣的航程?科研人員從出水瓷瓶內的沉積物中,“打撈”出了它的生命史。通過對長江口二號沉船出水青花雙耳瓶中的土壤沉積物進行環境因子與沉積物古DNA分析,來自復旦大學、華東師......

    從時空尺度揭示DNA內部隱藏世界

    在近日一項發表于《自然》的研究中,科學家繪制出迄今最詳盡的人類活細胞內DNA折疊、環狀纏繞和移動的圖譜,展示了基因組結構隨時間推移的變化情況,揭示了隱藏的基因調控機制,是了解DNA結構如何塑造人類生物......

    我國學者在快速低成本基因測序方法研究方面取得進展

    圖基于卷對卷流體的新一代快速低成本基因測序技術在國家自然科學基金項目(批準號:22027805、22334004、22421002)等資助下,福州大學楊黃浩、陳秋水團隊與華大生命科學研究院秦彥哲、章文......

    熒光傳感器實時監測DNA損傷及修復

    荷蘭烏得勒支大學研究人員開發出一款全新熒光傳感器,可在活細胞乃至活體生物中實時監測DNA損傷及修復過程,為癌癥研究、藥物安全測試和衰老生物學等領域提供了重要的新工具。相關成果發表于新一期《自然·通訊》......

    方顯楊研究組與合作者共同開發了一種新型活細胞DNA成像技術

    三維基因組互作與表觀遺傳修飾是基因表達調控的重要因素,其動態變化與細胞生長發育及癌癥等疾病的發生發展密切相關。解析染色質在活細胞內的時空動態,是理解基因調控機制的重要科學問題。現有基于CRISPR-C......

    拿破侖的軍隊是如何滅亡的?DNA揭示令人意外的疾病因素

    1812年,法國皇帝拿破侖一世從俄羅斯莫斯科撤退時,其大部分軍隊因饑餓、疾病和寒冷的冬天而損失殆盡。如今,對這撤退途中喪生的30萬士兵的部分遺骸的DNA的分析發現,兩種未曾預料到的細菌性疾病很可能增加......

  • <noscript id="yywya"><kbd id="yywya"></kbd></noscript>
  • 东京热 下载