PFGE：脈沖電場凝膠電泳（pulsed-field gel electrophoresis），在脈沖電場中，DNA分子的遷移方向隨著電場方向的周期性變化而不斷改變。
在標準的PFGE中，第一個脈沖的電場方向在另一側成45°夾角。由于瓊脂糖凝膠的電場方向、電流大小及作用時間都在交替變化，使得DNA分子能夠隨時調整其游動方向，以適應凝膠孔隙的無規則變化。與相對分子質量較小的DNA相比，相對分子質量較大的DNA需要更多的脈沖次數來更換其構型和方位，使其按新的方向游動。應用脈沖電場凝膠電泳技術，可成功分離到高達7MB的DNA大分子。