腦膜炎奈瑟菌（N. meningitidis）簡稱為腦膜炎球菌（meningococcus），是流行性腦脊髓膜炎（簡稱流腦）的病原菌。腎形或豆形革蘭陰性雙球菌，兩菌接觸面平坦或略向內陷，直徑0.6~0.8μm。人工培養后可成卵圓形或球狀，排列較不規則，單個、成雙或4個相聯等。在孵育24h后的培養物中，常呈現衰退形態，菌體大小較不一致，著色亦深淺不勻。在患者腦脊液中，多位于中性粒細胞內，形態典型。新分離菌株大多有莢膜和菌毛
腦膜炎雙球菌，又名腦膜炎奈瑟菌或腦脊髓膜炎雙球菌，簡稱為腦膜炎球菌，是一種革蘭氏陰性菌，因其所導致的腦膜炎而聞名，亦會造成腦膜炎球菌血癥(一種致命性的敗血癥)。它只感染人類，并無寄生的動物，是唯一令細菌性感染腦膜炎成為流行病的病菌。約10%成人的鼻咽中有它的蹤跡。