形態與染色
腦膜炎奈瑟菌為革蘭染色陰性，常呈雙排列，直徑約為0.8μm的雙球菌。單個菌體呈腎形。成雙排列時，兩個凹面相對。無鞭毛，不形成芽胞。有菌毛，新分離菌株有莢膜。
培養特性
專性需氧。營養要求高。最常用的培養基是巧克力色培養基。即將血液加熱80℃后制成的血瓊脂培養基。初次分離培養時，還需提供5%～10%的CO2氣體。一般培養48小時后，腦膜炎奈瑟菌在培養基上形成圓形隆起、表面有光澤、透明或半透明、直徑約1mm～5mm的露滴樣粘液型菌落。無色素形成。血平板上無溶血現象。
生化反應
分解糖類產酸不產氣。氧化酶試驗陽性。腦膜炎奈瑟菌可產生自溶酶，人工培養時若不及時移種，數日后菌體自溶。