有兩種ADA同種型：ADA1和ADA2。
ADA1存在于大多數體細胞中，特別是淋巴細胞和巨噬細胞中，它不僅存在于胞質溶膠和細胞核中，而且還存在于與二肽基肽酶-4（aka，CD26）連接的細胞膜上的外胚層中。ADA1主要參與細胞內活動，并且以小形式（單體）和大形式（二聚體）存在。小型到大型的相互轉換受肺中“轉換因子”的調節。
ADA2首次在人類脾臟中發現。隨后在包括巨噬細胞在內的其他組織中發現它與ADA1共存。這兩種同種型調節腺苷與脫氧腺苷的比例，增強了寄生蟲的殺滅。ADA2主要存在于人血漿和血清中，并且僅作為同型二聚體存在。