在法醫檢驗實踐中，由于尸體自溶與組織壞死有著共同的變化過程和相似的形態，因此，有時不好區別。如果單就一個細胞來說確實無法區別這兩者，但是只要全面檢查、全面分析，正確區分它們也是不難的。
首先，可以從分布特點上區分，如果將要檢查部分固定起來，則固定部分的自溶是從中間開始的，未固定而又離體的部分的自溶是從邊緣開始的，這是規律。生前形成的壞死，則沒有這種分布規律。
其次，可以從速度和程度上分。各處器官、內臟、組織、細胞的自溶速度和程度，如前所述，是有一定的順序的，而壞死則不具有這種順序性。法醫在尸檢時，如果發現胰臟尚無明顯自溶、而心、腎、肝、腦等組織就有細胞核濃縮、碎裂或溶解，則首先應考慮生前形成的病變。以此類推。
第三，可以從形狀上分。自溶通常是彌漫性的，而壞死則往往是局部性的。
第四，可以從病理變化上分。組織壞死的，在壞死灶周圍一般都有炎癥反應，而自溶灶周圍則沒有這種病理變化。
第五，可以從條件上分。自溶的發展一般都可以從當時的氣溫、死亡時間、死因等方面找到原因，而生前病變則常有臨床資料可供參考。
此外，有些臟器的自溶有其獨特性，如果不符合這些特性，則可以排除其是自溶。