液相色譜儀只要求樣品能制成溶液，不受樣品揮發性的限制，流動相可選擇的范圍寬，固定相的種類繁多，因而可以分離熱不穩定和非揮發性的、離解的和非離解的以及各種分子量范圍的物質。
液相色譜儀的系統由儲液器、泵、進樣器、色譜柱、檢測器、記錄儀等幾部分組成。儲液器中的流動相被高壓泵打入系統，樣品溶液經進樣器進入流動相，被流動相載入色譜柱（固定相）內，由于樣品溶液中的各組分在兩相中具有不同的分配系數，在兩相中作相對運動時，經過反復多次的吸附-解吸的分配過程，各組分在移動速度上產生較大的差別，被分離成單個組分依次從柱內流出，通過檢測器時，樣品濃度被轉換成電信號傳送到記錄儀，數據以圖譜形式打印出來。
液相色譜儀按其分離機理，可分為四種類型。
吸附色譜法的固定相為吸附劑，色譜的分離過程是在吸附劑表面進行的，不進入固定相的內部。與氣相色譜不同，流動相（即溶劑）分子也與吸附劑表面發生吸附作用。在吸附劑表面，樣品分子與流動相分子進行吸附競爭，因此薄層色譜(TLC)流動相的選擇對分離效果有很大的影響，進口液相色譜儀一般可采用梯度淋洗法來提高色譜分離效率。
在聚合物的分析中，吸附色譜一般用來分離添加劑，如偶氮染料、抗氧化劑、表面活性劑等，也可用于石油烴類的組成分析。
分配色譜法
這種色譜的流動相和固定相都是液體，樣品分子在兩個液相之間很快達到平衡分配，利用各組分在兩相中分配系數的差異進行分離，類似于萃取過程。
一般常用的固定液有（ODPN）、聚乙二醇（PEG400～4000）、三甲撐乙二醇（TMG）和角鯊烷（SQ）。采用與氣相色譜（GC）同樣的方法，將固定液涂漬在多孔的載體表面，但在使用中固定液易流失。目前，應用較多的是鍵合固定相。在這種固體相中，固定液不是涂在載體表面，而是通過化學反應在純硅膠顆粒表面鍵合上某種有機基團。
例如，利用氯代十八烷基硅烷與硅膠表面的羥基（-OH）之間的反應就可以形成一烷基化表面。這種固定液的優點是不易被流動相剝蝕。在分配色譜法中，流動相可為純溶劑薄層色譜(TLC)，也可以采用混合溶劑進行梯度淋洗，其極性應與固定液差別大一些，以避免兩者之間相溶。
與試樣預處理技術相配合，液相色譜儀所達到的高分辨率和高靈敏度，使分離和同時測定性質上十分相近的物質成為可能，能夠分離復雜相體中的微量成分。隨著固定相的發展，有可能在充分保持生化物質活性的條件下完成其分離。
液相色譜儀有“四高一廣”的特點：
①高壓：流動相為液體，流經色譜柱時，受到的阻力較大，為了能迅速通過色譜柱，必須對載液加高壓。
②高速：分析速度快、載液流速快，較經典液體色譜法速度快得多，通常分析一個樣品在15～30分鐘，有些樣品甚至在5分鐘內即可完成，一般小于1小時。
③：分離效能高。可選擇固定相和流動相以達到分離效果，比工業精餾塔和氣相色譜的分離效能高出許多倍。
1、使用甲醇作流動相，請注意自身保護和環境保護，廢液注入空瓶內，集中處理，不得倒入下水道內。
2、輸液泵使用前，先注意探漏檢查，視各密封點和泵體有否漏液薄層色譜(TLC)。
3、在無流動相通入的情況下，嚴禁啟動泵體電機，以免柱塞密封環磨損。
4、測試泵流量性能時，用于收集液體的容器，應選用小口瓶頸的容器，防止收集過程中，溶液蒸發，影響測量精度。必要時應將其密封存放在干燥容器內，以預防光學系統霉變。
5、金屬泵體的輸液泵，應盡量避免使用含有鹵離子（如KCL、NaCL、NH4CL）的流動相或能產生鹵離子的流動相，若必須使用此類流動相，建議使用泵體用非金屬材料制造的輸液泵。方則使用后，應立即使用去離子水清洗泵體和整個色譜系統的管路。
6、使用的流動相必須是HPLC級或分析純級，特別是配置的流動相，在使用前，必須過濾掉其中的顆粒狀雜質和其他物質（使用0.45μm的濾膜過濾）
7、長期不使用輸液泵，應在后分析結束時，用注射器吸取去離子水通過專用的泵頭清洗孔清洗泵體和柱塞桿。以延長密封圈和寶石柱塞桿的壽命。
8、輸液泵液路在維修或保養時，應切斷儀器電源。非專業維修人員請不要打開機箱罩。
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