蘆薈的葉片中含有超過二百種化合物，當中包括有20種礦物質、18種氨基酸、12種維生素及其他各種不同的養分，包括多種黏多糖、脂肪酸、蒽醌類及黃酮類化合物、糖、活性酶等。蒽醌類又名安特拉歸農綜合體(Anthraquinone complex)，有消毒殺菌的功效，主要存在于汁液里。
蘆薈的表皮含有蘆薈素，其主要生物活性成分為蘆薈苷。蘆薈苷通常被認為是具有瀉下作用、被用于瀉藥的成分，但實際上蘆薈苷在人體內與腸道菌群作用產生蘆薈大黃素，蘆薈大黃素通過刺激大腸蠕動產生較強的瀉下作用、令服用者腹瀉，強烈的腹瀉會誘發孕婦產生假性宮縮，嚴重且頻繁的假性宮縮會誘發真宮縮，從而有可能引起孕婦流產。因此蘆薈必須去皮食用。