假如你問一個研究人員選擇芯片掃描儀（microarray scanner）的時候，主要考慮什么性能？他們很可能回答說：“速度和分辨率”，因此不用感到奇怪生產廠商會在這些關鍵性能上下大功夫。從以下列出來的芯片掃描儀產品你就可以看到，在掃描芯片的速度和分辨率性能方面總是會出現一山還比一山高的情況。
然而對于許多研究人員來說，處理能力和易操作性漸漸也成為了他們挑選芯片掃描儀時的選擇條件了，以下列出的掃描儀系統中，就可以看到帶有small footprint單芯片處理（single-slide capability）的掃描儀——對于那些需要調整單芯片或者雙芯片的研究人員來說非常方便，與此相反的另一個方面就是可以同時處理48芯片的掃描儀。
掃描儀的易操作性很大程度上是通過軟件實現的，尤其是你需要檢查網格性能（gridding capability）的時候——沒有什么比手動檢查組成微陣列芯片中成千上萬的spots是否處于網格的正確位置更讓人感到挫敗感和耗時的事情了。
產品：AQuire 110V
廠家：Genetix
產品描述：來自Genetix公司的AQuire是一種高分辨率的激光共聚焦掃描儀，用于芯片結果的快速掃描成像和分析。該系統具有標準的雙重濾光器和激光，可同時獲得Cy3TM和Cy5TM染料的結果和一些其他染料的結果。AQuire由于對PMT實時控制和對擴大信號的調整，使其具備了高靈敏度。AQuire還具有較好的靈活性，能對大范圍的掃描面積和芯片類型（包括沒有蓋玻片的濕制備芯片）進行掃描成像。
產品：DNA Microarray Scanner
廠家：Agilent Technologies
產品描述：技術上進一步提高使得掃描成為輕而易舉的事情。在強大的工程學技術基礎上和多年的芯片掃描儀市場的經驗基礎上，Agilent公司向市場投放了功能強大和全自動的掃描儀，該新型的增強版的DNA芯片掃描儀是市場上首個可以通讀“1x3”玻片的48芯片掃描系統。并使用了Agilent公司的Extraction Software。行業中首個采用了動態自動對焦技術（Dynamic Autofocus），提高了靈敏度，與先進的分析軟件結合使得你的實驗結果更有說服力。
產品：GenePix Personal 4100A Microarray Scanner
廠家：Molecular Devices
產品描述：GenePix Personal 4100A芯片掃描儀能滿足你在基因組、蛋白組或者藥物篩選的芯片研究中對靈敏度、通量、可靠性和靈活性的要求。The GenePix Personal整合了連續掃描模型，使其能降低研發和制造的成本而不會降低產品的質量和性能。GenePix Personal具有與GenePix 4000B相同的成像規格。你可以選擇一個或者兩個激光和多達八個發散濾光器，使得你經濟地、靈活地進行各種試驗。停止排隊使用公用儀器吧！GenePix可以幫助你擁有自己的掃描儀。