芯片有望成為產前診斷的標準方法

　　根據近期發表在《新英格蘭醫學雜志》上的一篇文章，芯片能夠比傳統的核型分析提供更多臨床上相關的信息，從而有望成為產前診斷的標準方法。

　　這項研究是由哥倫比亞大學醫學中心領導的，埃默里大學、Baylor醫學院和Signature Genomics也參與了研究工作。他們的主要目標是與傳統的核型分析相比較，評估芯片分析的準確性、有效性和潛在優勢。他們的次要目標是評估分析性能。自上世紀70年代起，核型分析就成為了產前診斷的標準方法。

　　在四年的時間里，研究人員利用Affymetrix和安捷倫制造的芯片以及核型分析，對4,400名患者開展了試驗。他們從高齡產婦中收集了羊水，并對胎兒進行早期篩查，了解唐氏綜合征的風險是否升高，并通過超聲波檢查結構異常，以及其他問題。所有樣品被送到一個參考實驗室，開展染色體分析。所有數據提交到NCBI，對公眾免費開放。

　　研究人員發現，基于芯片的分析與核型分析一樣，能夠識別常見的非整倍體(即染色體數目異常)，這會導致唐氏綜合征(21三體)和愛德華茲綜合征(18三體)等疾病。此外，對于超聲波檢查到生長或結構異常的胎兒，芯片能夠在6%的病例中檢測到臨床相關的染色體缺失或重復，而核型分析并未檢測到。另外，對于高齡產婦或篩查結果呈陽性的病例，芯片技術能夠發現1.7%的異常(即每60個孕婦中的1個)，而她們有著正常的核型。

　　根據這些結果，第一作者Ronald Wapner認為，芯片將取代核型分析，成為評估胎兒染色體異常的標準方法，并認為芯片所發現的染色體微缺失和微擴增也常常伴隨著嚴重的臨床問題。Wapner是哥倫比亞大學醫學中心婦產科的教授。

　　據安捷倫公司介紹，該公司的芯片和試劑在研究中發揮了重要作用。71%的樣品是在安捷倫的SurePrint CGH芯片上運行的，而數據分析時也用了安捷倫的軟件。安捷倫還協助研究人員開發了定制芯片。研究總共使用了5,500塊芯片。

　　目前，芯片分析所使用的樣品需要通過侵入手段獲得胎兒細胞，如羊水穿刺或絨毛取樣。Wapner認為，一旦有了非侵入性方法來檢測胎兒的遺傳性異常，所有孕婦都應該進行芯片分析，而不只是那些高風險孕婦。

　　Wapner也在文中提到，隨著胎兒的全基因組測序在臨床上變得可行，從芯片分析中吸取的經驗教訓也會有所幫助，將有助于確保新技術的合理應用。目前一些公司已經推出了基于測序的檢測，來實現非整倍體的非侵入性產前診斷，包括Sequenom、Ariosa Diagnostics和Verinata Health。

　　美國醫學遺傳學協會在兩年前更新了其指引，建議將芯片作為第一輪產后評估檢測，來診斷那些患有發育遲緩或智力障礙、自閉癥或多種先天性異常的患者。然而，在產前背景下，該機構仍然認為芯片應當作為核型分析的輔助檢測。

　　盡管如此，目前有多家機構和公司提供基于芯片的產前檢測。Baylor醫學院于2004年最先在美國推出基于芯片的產前檢測，而Signature Genomics(如今屬于PerkinElmer)和CombiMatrix也在近幾年推出類似的服務。