藥物正作用是主要的.一種藥物常有多方面的作用，既有治療目的的作用也并存有非治療目的的作用。如抗膽堿藥阿托品，其作用涉及許多器官和系統，當應用于解除消化道痙攣時，除了可緩解胃腸疼痛外，常可抑制腺體分泌，出現口干、視力模糊、心悸、尿潴留等反應。
副作用和治療作用在一定條件下是可以轉化的，治療目的的不同，也導致副作用的概念上的轉變。如在手術前為了抑制腺體分泌和排尿，阿托品的上述副作用又轉化為治療作用了。副作用常為一過性的，隨治療作用的消失而消失。但是有時候也可引起后遺癥。
