1.一般治療 適當注意休息和營養。預防感染可防止貧血加劇。輕型病例無明顯癥狀者僅給予一般治療即可。
2.對癥治療
(1)輸血：是重型β-珠蛋白生成障礙性貧血有效療法。國外采用高量輸血，開始每周輸1次，可輸新鮮或經等滲鹽水洗滌過的紅細胞或壓縮紅細胞，反復多次使Hb升至120～140g/L。然后定期每隔4～5周1次，每次輸入20ml/kg或壓縮紅細胞15ml/kg，維持Hb＞80g/L。這樣使病人保持較高的Hb水平，以消除貧血癥狀，防止嚴重并發癥發生。
(2)鐵螯合劑：反復輸血可導致繼發性含鐵血黃素沉著癥，如反復輸血＞100次，血清鐵飽和度＞80%者應給予螯合劑去鐵胺(deferoxamine)。去鐵胺可與體內過量三價鐵形成大分子復合物從尿中排出。劑量每天20～40mg/kg，加在注射用水或生理鹽水中靜滴，可于晚上睡眠時給予，每次維持8h，每周連用5～6晚；也可采用肌注或便攜式輸液泵作腹壁皮下注射，8～12h給予。主要不良反應為皮疹，藥物過量可致長骨生長障礙、白內障等。口服螯合劑deferiprone也可應用，可促進鐵的排出。推薦劑量為每天75～100mg/kg。主要不良反應為粒細胞減少、關節炎、肌肉痛等，少部分病例出現胃腸道反應，嚴重者應停藥。有報道認為該藥長期應用能增加肝臟內鐵貯存，因此，長期單獨應用似不足于有效預防慢性鐵中毒。鐵螯合劑應用時，宜用大劑量維生素C口服以增加尿鐵的排出。
(3)抗氧化劑治療：可長期口服維生素E 50～150mg/d，有抗紅細胞膜脂質的過氧化損傷，減少溶血作用。
(4)脾切除或脾栓塞術：可改善貧血癥狀和減少輸血次數。適用于：①輸血日益增多者；②巨脾引起壓迫癥狀者；③合并脾功能亢進者。脾切除一般于5～6歲后施行。本療法可減輕貧血癥狀和減少輸血量。
3.基因活化療法 應用化學藥物重新活化γ珠蛋白的基因，與過量α珠蛋白結合使HbF的合成增加，改善β-珠蛋白生成障礙性貧血的癥狀。化學藥物有羥基脲每天15mg/kg，每3周為1個療程。可重復使用；有報道連續使用3年而無明顯毒性不良反應。此外可用阿糖胞苷、白消安(馬利蘭)、長春新堿等。也有應用異煙肼每天15～20mg/kg，每3周為1個療程，可使過量的α珠蛋白減少。
4.造血干細胞移植 異基因骨髓或臍血干細胞移植成功后的5年無病生存率達80%以上。可采用HLA匹配的同胞姊妹、父母或者非親緣供者的骨髓、G-CSF、動員外周血以及臍血造血干細胞。
5.基因治療 目前正在研究中。