（1）血壓管理 降壓治療可以降低卒中風險已經得到眾多研究證實，歐洲高血壓指南2009年更新版中將卒中二級預防血壓目標值從2007年的<130/80mmHg調整為“謹慎推薦達標值在130～139/80～85mmHg。理想的降壓策略可能在幾天或幾周時間內逐步平穩而安全地降壓，最好在腦灌注監測條件下進行。在藥物選擇方面，多數隨機對照研究證明，降壓藥物預防卒中的主要效益來自降血壓本身。五種常用降壓藥，包括利尿劑、B受體阻滯劑、鈣通道阻滯劑（CCB）、血管緊張素轉化酶抑制劑（ACEI）和血管緊張素轉化酶受體阻斷劑（ARB），均可用于卒中預防，其中利尿劑，以及利尿劑聯合ACEI在卒中二級預防中的作用得到確證。
（2）抗栓治療 由于阿司匹林對于總體的缺血性卒中二級預防治療明確獲益，關于腦動脈粥樣硬化的所有的抗凝或抗血小板治療的療效評價，都是以阿司匹林為對照的基礎上進行的。
①抗凝治療 臨床試驗表明，華法林在腦動脈粥樣硬化患者預防腦卒中或血管性死亡事件方面不優于阿司匹林，反而有更高的嚴重出血風險，提示腦動脈粥樣硬化患者應優先應用阿司匹林而非華法林。②抗血小板治療 單一抗血小板藥物對于整體的缺血性卒中/TIA（短暫性缺血性發作）的二級預防，目前各國指南均推薦使用單一抗血小板治療，還沒有針對腦動脈粥樣硬化患者進行單一抗血小板藥物與安慰劑之間、單一抗血小板藥物與其他藥物之間的比較研究。高復發風險患者選用氯吡格雷優于阿司匹。③聯合抗血小板治療 聯合治療較單用阿司匹林治療有減少卒中復發的趨勢，但是無統計差異。高復發風險患者氯吡格雷優于阿司匹林，該結論可能也適合腦動脈粥樣硬化患者。
（3）調脂治療 研究表明，他汀類藥物治療可以顯著降低腦卒中或TIA的復發風險，進一步分析表明，強化降脂（LDL-C較基線下降≤50%）獲益更多。此外，很多影像學隨機對照研究表明，他汀類藥物可以穩定、甚至逆轉冠脈和頸動脈粥樣硬化。
（4）血糖控制研究表明糖尿病患者血糖控制在HbA1C（糖化血紅蛋白）低于7%或者在7%左右時，可以預防各種微血管并發癥和糖尿病周圍神經病，如果一旦診斷糖尿病，即早期開始控制在上述水平，大血管并發癥也可獲益。但是還沒有研究觀察控制血糖對腦動脈粥樣硬化預防卒中復發或對狹窄動脈本身的療效。目前只能參考對于整體缺血性卒中和糖尿病的指南中的血糖處理建議。