獲得性補體缺陷是補體活化（如循環免疫復合物或內毒素存在的情況下）過程中造成的，它可增加患者對感染的易感性。遺傳性和獲得性補體缺陷的區別見表80-2。在臨床上，獲得性初體缺陷很常見，如燒傷患者伴有的低補體血癥和敗血癥；腎病綜合征患者易患感染性疾病，其血清補體水平也有異常；腫瘤化療患者可伴有低補體血癥、調理及殺菌功能障礙；鐮刀細胞貧血患者常繼發補體缺陷，此類患者常伴有嚴重的細菌感染，尤其是肺炎球菌和流感嗜血桿菌感染。Koethe等人認為這是由于患者體內D因子部分缺陷使患者的調理功能受損所致；脾臟切除術后也出現調理功能障礙；在營養狀況差、蛋白質熱卡不足時，也會造成所有補體成分功能低下。另外，一些自身免疫性疾病和免疫復合物性疾病過程中造成的補體大量消耗也是造成補體缺陷的原因，治療原發病可糾正補體缺陷。