①對血吸蟲病的治療
萱草根（麝香萱根）對實驗治療日本血吸蟲病的療效，文獻報道不一，有認為減蟲率達80%以上，有認為減蟲率不高，也有認為蟲數不減少；曾有人進一步研究認為，萱草根對感染血吸蟲尾蚴的小白鼠無預防作用，與廣木香、檳榔、黃連、黃柏、南瓜子漿粉合用均無效，與酒石酸銻鉀合用亦不表現增效。萱草根（包括鎮江產的黃花萱草）對血吸蟲成蟲的作用，主要表現為蟲體萎縮和生殖器官退化，但這些變化都是可逆的，停藥后迅速恢復，家犬治療后糞便孵化可以轉陰，或毛蚴減少，經一定時間后仍可轉陽。由于萱草根對宿主有強烈的毒性，安全度小，在宿主致死情況下，尚不能殺死蟲體，故臨床價值較低。企圖通過化學方法將有效成分與毒性成分分離，但初步看來兩者很可能是同一物質。 [11]
②抗結核作用
萱草根在治療血吸蟲病時，其有效部分與毒性部分不易分離，加溫后毒性可顯著降低，但對血吸蟲病的治療作用亦喪失，而對結核菌的抑制力卻不變，不僅試管實驗有效，對豚鼠實驗性結核亦表現療效，在臨床上也有一定效果。進一步分離董草根的各種成分，萱草乙醚浸膏對豚鼠實驗性結核病，萱Ⅲ對小白鼠實驗性結核病減輕病變作用雖尚不夠顯著，但也未見到動物視神經萎縮等嚴重毒性反應。
此外，萱草根與川烏合用，可滅螺。 [11]
根、葉可入藥，藥用價值較高，具有健腦和明目等功效，能顯著降低血清膽固醇含量。黃花菜含鐵量很高，對補血止血有奇效，可作為婦女補血佳品。[8]
毒性
萱草根對宿主具有強烈的毒性，對小白鼠所引起的病理變化，主要表現為腦、脊髓白質部和視神經纖維索普遍軟化和髓鞘脫失，灰質部的病變一般均較輕微；此外，肝、腎細胞有不同程度的濁腫，肺部有郁血或斑狀出血；家兔、犬中毒癥狀表現為瞳孔散大，對光反射消失、失明、后肢癱瘓和膀胱潴尿等而致死亡；家兔在萱草根中毒時出現尿蛋白，但無膽紅素，血清轉氨酶也正常，說明受損害者，主要為腎，而未傷及肝，從出現尿糖及葡萄糖耐量降低，看出糖代謝異常。萱草的毒性主要集中于根中，其毒性因產地不同而有很大差異，加熱60℃以上可使毒性減弱，甚至完全破壞。萱草根在體內有很大的蓄積作用，感染血吸蟲的動物對萱草根的耐受較未感染者低，用米泔水泡制不能減低藥物的毒性，黃連、黃柏可部分解除它的毒性。[11]