落地式大容量冷凍連續流離心機工作時，通過蠕動泵將樣品懸浮液加入到連續流轉子中，在離心力的作用下，顆粒從樣品懸浮液中沉降出來，聚集在一個或多個分離腔內，上清液受到加入樣品懸浮液的壓力不斷從轉子中溢出。離心停止后，刮出聚集在分離腔內的顆粒。
連續流轉子分離懸浮液的效率主要取決于要收集顆粒的大小、形狀、密度以及轉子轉速、轉子容量和液流速度等。實踐中要根據顆粒特性優化選擇轉速和蠕動泵流速，使懸浮液中的顆粒最大程度的沉降出來。
