在介質中，各種脂蛋白帶負電，而各種脂蛋白中蛋白質含量越高，在電場的作用下，電荷量越大分子量越小，電泳速度就越快，CM蛋白質含量很少，98%是不帶電的脂類，特別是TG含量最高，在電場中幾乎不移動。
電泳法是根據各種脂蛋白所帶電荷不同，在電泳圖譜中的位置不同而分類的，共分為乳糜微粒、β-脂蛋白、前β-脂蛋白和α-脂蛋白。
對于分子量較大的樣品，如大分子核酸、病毒等，一般可采用孔徑較大的瓊脂糖凝膠進行電泳分離。瓊脂糖凝膠具有網絡結構，物質分子通過時會受到阻力，大分子物質在涌動時受到的阻力大。
