蛋白組學的研究方法

蛋白組學的研究方法如下：

蛋白質組學的發展既是技術所推動的也是受技術限制的。蛋白質組學研究成功與否，很大程度上取決于其技術方法水平的高低。蛋白質研究技術遠比基因技術復雜和困難。

不僅氨基酸殘基種類遠多于核苷酸殘基（20/4）, 而且蛋白質有著復雜的翻譯后修飾，如磷酸化和糖基化等，給分離和分析蛋白質帶來很多困難。此外，通過表達載體進行蛋白質的體外擴增和純化也并非易事，從而難以制備大量的蛋白質。

蛋白質組學的興起對技術有了新的需求和挑戰。蛋白質組的研究實質上是在細胞水平上對蛋白質進行大規模的平行分離和分析，往往要同時處理成千上萬種蛋白質。因此，發展高通量、高靈敏度、高準確性的研究技術平臺是現在乃至相當一段時間內蛋白質組學研究中的主要任務。

當前在國際蛋白質組研究技術平臺的技術基礎和發展趨勢有以下幾個方面： 蛋白質組數據庫是蛋白質組研究水平的標志和基礎。瑞士的SWISS-PROT擁有目前世界上最大，種類最多的蛋白質組數據庫。丹麥、英國、美國等也都建立了各具特色的蛋白質組數據庫。

生物信息學的發展已給蛋白質組研究提供了更方便有效的計算機分析軟件；特別值得注意的是蛋白質質譜鑒定軟件和算法發展迅速，如SWISS-PROT、Rockefeller大學、BHS寶護神、UCSF等都有自主的搜索軟件和數據管理系統。

最近發展的質譜數據直接搜尋基因組數據庫使得質譜數據可直接進行基因注釋、判斷復雜的拼接方式。隨著基因組學的迅速推進，會給蛋白質組研究提供更多更全的數據庫。另外，對肽序列標記的從頭測序軟件也十分引人注目。