蛋白質在胃液消化酶的作用下，初步水解，在小腸中完成整個消化吸收過程。
氨基酸的吸收通過小腸黏膜細胞，是由主動運轉系統進行，分別轉運中性、酸性和堿性氨基酸。
在腸內被消化吸收的蛋白質，不僅來自于食物，也有腸黏膜細胞脫落和消化液的分泌等，每天有70g左右蛋白質進入消化系統，其中大部分被消化和重吸收。未被吸收的蛋白質由糞便排出體外。
